1つのスマートフォンに複数のアプリをインストールし、1つの050番号を複数のアプリに設定した場合、利用可能ですか？

どのアプリからも発信は可能です。

着信時に起動するアプリは最後に弊社IP-Phone設備と通信（REGISTER登録）したものになります。
なお、しばらく通信がない場合は着信しません。